Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MLH1P40692 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MLH1P40692 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MLH1P40692 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MLH1P40692 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MLH1P40692 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MLH1P40692 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MLH1P40692 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MLH1P40692 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MLH1P40692 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MLH1P40692 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MLH1P40692 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MLH1P40692 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MLH1P40692 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MLH1P40692 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MLH1P40692 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MLH1P40692 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MLH1P40692 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MLH1P40692 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MLH1P40692 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MLH1P40692 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MLH1P40692 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
MLH1P40692 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
MLH1P40692 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MLH1P40692 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MLH1P40692 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MLH1P40692 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MLH1P40692 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MLH1P40692 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MLH1P40692 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MLH1P40692 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MLH1P40692 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MLH1P40692 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
MLH1P40692 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MLH1P40692 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MLH1P40692 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MLH1P40692 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
MLH1P40692 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MLH1P40692 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MLH1P40692 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MLH1P40692 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MLH1P40692 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MLH1P40692 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MLH1P40692 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MLH1P40692 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MLH1P40692 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MLH1P40692 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MLH1P40692 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MLH1P40692 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MLH1P40692 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MLH1P40692 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MLH1P40692 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MLH1P40692 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MLH1P40692 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MLH1P40692 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MLH1P40692 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MLH1P40692 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MLH1P40692 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MLH1P40692 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MLH1P40692 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MLH1P40692 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MLH1P40692 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MLH1P40692 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MLH1P40692 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MLH1P40692 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MLH1P40692 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MLH1P40692 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MLH1P40692 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MLH1P40692 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MLH1P40692 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MLH1P40692 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MLH1P40692 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MLH1P40692 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MLH1P40692 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MLH1P40692 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MLH1P40692 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MLH1P40692 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
MLH1P40692 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MLH1P40692 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MLH1P40692 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MLH1P40692 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MLH1P40692 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MLH1P40692 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MLH1P40692 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MLH1P40692 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MLH1P40692 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MLH1P40692 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MLH1P40692 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MLH1P40692 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MLH1P40692 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MLH1P40692 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MLH1P40692 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MLH1P40692 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MLH1P40692 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
MLH1P40692 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
MLH1P40692 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
MLH1P40692 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MLH1P40692 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MLH1P40692 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MLH1P40692 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms