Protein–RNA interactions for Protein: O00501

CLDN5, Claudin-5, humanhuman

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN5O00501 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN5O00501 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN5O00501 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN5O00501 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN5O00501 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN5O00501 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN5O00501 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN5O00501 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN5O00501 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN5O00501 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN5O00501 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN5O00501 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN5O00501 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN5O00501 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN5O00501 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN5O00501 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN5O00501 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN5O00501 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN5O00501 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN5O00501 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN5O00501 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN5O00501 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN5O00501 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN5O00501 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN5O00501 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN5O00501 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN5O00501 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN5O00501 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN5O00501 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN5O00501 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN5O00501 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN5O00501 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CLDN5O00501 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CLDN5O00501 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN5O00501 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CLDN5O00501 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN5O00501 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CLDN5O00501 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CLDN5O00501 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN5O00501 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CLDN5O00501 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CLDN5O00501 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CLDN5O00501 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CLDN5O00501 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN5O00501 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN5O00501 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN5O00501 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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CLDN5O00501 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN5O00501 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN5O00501 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN5O00501 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN5O00501 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN5O00501 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN5O00501 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN5O00501 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN5O00501 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN5O00501 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN5O00501 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN5O00501 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN5O00501 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN5O00501 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN5O00501 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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