Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CLIP2Q9UDT6 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms