Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 DCLK3-203ENST00000636136 5446 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 HS6ST1-201ENST00000259241 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 HDAC7-202ENST00000354334 4065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 HDAC7-201ENST00000080059 4095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 AP3S2-201ENST00000336418 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 ALDH9A1-201ENST00000354775 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 SPATA6-203ENST00000371847 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 CMIP-208ENST00000566462 3512 ntTSL 4 BASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 KMT2A-201ENST00000389506 13655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 ARSG-201ENST00000448504 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 AL133216.2-201ENST00000622550 7213 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 TNFRSF8-201ENST00000263932 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 SETDB2-203ENST00000354234 6139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 BCOR-202ENST00000378444 6358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 COL4A6-209ENST00000545689 6380 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 GAS7-201ENST00000323816 8033 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 GAS7-204ENST00000437099 8003 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 IGSF3-202ENST00000369483 7326 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 KDM3A-216ENST00000542128 4311 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 GATAD2A-201ENST00000358713 5510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 PLXNA3-201ENST00000369682 10885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 PCDHA4-204ENST00000618834 10557 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms