Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP4P49662 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP4P49662 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP4P49662 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP4P49662 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP4P49662 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP4P49662 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP4P49662 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP4P49662 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP4P49662 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP4P49662 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP4P49662 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP4P49662 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP4P49662 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP4P49662 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP4P49662 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP4P49662 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP4P49662 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP4P49662 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP4P49662 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP4P49662 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP4P49662 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP4P49662 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP4P49662 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP4P49662 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP4P49662 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP4P49662 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP4P49662 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP4P49662 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP4P49662 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP4P49662 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP4P49662 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP4P49662 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP4P49662 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP4P49662 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP4P49662 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP4P49662 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP4P49662 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP4P49662 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP4P49662 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP4P49662 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP4P49662 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP4P49662 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP4P49662 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP4P49662 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP4P49662 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP4P49662 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP4P49662 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP4P49662 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP4P49662 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP4P49662 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP4P49662 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP4P49662 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP4P49662 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP4P49662 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP4P49662 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP4P49662 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP4P49662 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP4P49662 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP4P49662 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP4P49662 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP4P49662 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP4P49662 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP4P49662 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP4P49662 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP4P49662 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP4P49662 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP4P49662 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP4P49662 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP4P49662 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP4P49662 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP4P49662 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP4P49662 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP4P49662 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP4P49662 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP4P49662 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP4P49662 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP4P49662 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP4P49662 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP4P49662 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP4P49662 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP4P49662 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP4P49662 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP4P49662 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP4P49662 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP4P49662 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP4P49662 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP4P49662 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP4P49662 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP4P49662 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP4P49662 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP4P49662 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP4P49662 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP4P49662 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP4P49662 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP4P49662 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP4P49662 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP4P49662 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP4P49662 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP4P49662 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms