Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 ARHGEF10L-202ENST00000361221 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 CD38-201ENST00000226279 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 URGCP-201ENST00000336086 5658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 SPECC1-206ENST00000395530 8133 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 ZNF180-201ENST00000221327 4335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 SEMA6D-202ENST00000354744 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 PAX7-203ENST00000420770 5538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TMEM225BP0DP42 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms