Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SFMBT1Q9UHJ3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SFMBT1Q9UHJ3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SFMBT1Q9UHJ3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFMBT1Q9UHJ3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFMBT1Q9UHJ3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFMBT1Q9UHJ3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFMBT1Q9UHJ3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFMBT1Q9UHJ3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFMBT1Q9UHJ3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFMBT1Q9UHJ3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFMBT1Q9UHJ3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFMBT1Q9UHJ3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFMBT1Q9UHJ3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFMBT1Q9UHJ3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFMBT1Q9UHJ3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFMBT1Q9UHJ3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFMBT1Q9UHJ3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFMBT1Q9UHJ3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFMBT1Q9UHJ3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SFMBT1Q9UHJ3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SFMBT1Q9UHJ3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SFMBT1Q9UHJ3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SFMBT1Q9UHJ3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SFMBT1Q9UHJ3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFMBT1Q9UHJ3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFMBT1Q9UHJ3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFMBT1Q9UHJ3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFMBT1Q9UHJ3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFMBT1Q9UHJ3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SFMBT1Q9UHJ3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFMBT1Q9UHJ3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms