Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
XCL2Q9UBD3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms