Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM6

PKD2L2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L2Q9NZM6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKD2L2Q9NZM6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKD2L2Q9NZM6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKD2L2Q9NZM6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKD2L2Q9NZM6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKD2L2Q9NZM6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PKD2L2Q9NZM6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKD2L2Q9NZM6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKD2L2Q9NZM6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKD2L2Q9NZM6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKD2L2Q9NZM6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKD2L2Q9NZM6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKD2L2Q9NZM6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKD2L2Q9NZM6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKD2L2Q9NZM6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKD2L2Q9NZM6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKD2L2Q9NZM6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKD2L2Q9NZM6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKD2L2Q9NZM6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKD2L2Q9NZM6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKD2L2Q9NZM6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKD2L2Q9NZM6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKD2L2Q9NZM6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKD2L2Q9NZM6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKD2L2Q9NZM6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKD2L2Q9NZM6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKD2L2Q9NZM6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKD2L2Q9NZM6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKD2L2Q9NZM6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKD2L2Q9NZM6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKD2L2Q9NZM6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKD2L2Q9NZM6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKD2L2Q9NZM6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKD2L2Q9NZM6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKD2L2Q9NZM6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKD2L2Q9NZM6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKD2L2Q9NZM6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKD2L2Q9NZM6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKD2L2Q9NZM6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKD2L2Q9NZM6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKD2L2Q9NZM6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKD2L2Q9NZM6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKD2L2Q9NZM6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKD2L2Q9NZM6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKD2L2Q9NZM6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKD2L2Q9NZM6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKD2L2Q9NZM6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKD2L2Q9NZM6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKD2L2Q9NZM6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PKD2L2Q9NZM6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKD2L2Q9NZM6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKD2L2Q9NZM6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKD2L2Q9NZM6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKD2L2Q9NZM6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKD2L2Q9NZM6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKD2L2Q9NZM6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKD2L2Q9NZM6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKD2L2Q9NZM6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKD2L2Q9NZM6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKD2L2Q9NZM6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKD2L2Q9NZM6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKD2L2Q9NZM6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKD2L2Q9NZM6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKD2L2Q9NZM6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKD2L2Q9NZM6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKD2L2Q9NZM6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKD2L2Q9NZM6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKD2L2Q9NZM6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKD2L2Q9NZM6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKD2L2Q9NZM6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKD2L2Q9NZM6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKD2L2Q9NZM6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKD2L2Q9NZM6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKD2L2Q9NZM6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PKD2L2Q9NZM6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PKD2L2Q9NZM6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PKD2L2Q9NZM6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PKD2L2Q9NZM6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKD2L2Q9NZM6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKD2L2Q9NZM6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKD2L2Q9NZM6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKD2L2Q9NZM6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKD2L2Q9NZM6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKD2L2Q9NZM6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKD2L2Q9NZM6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKD2L2Q9NZM6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKD2L2Q9NZM6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKD2L2Q9NZM6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKD2L2Q9NZM6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PKD2L2Q9NZM6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PKD2L2Q9NZM6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PKD2L2Q9NZM6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PKD2L2Q9NZM6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PKD2L2Q9NZM6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PKD2L2Q9NZM6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKD2L2Q9NZM6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKD2L2Q9NZM6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKD2L2Q9NZM6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKD2L2Q9NZM6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKD2L2Q9NZM6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms