Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD9

FARSB, Phenylalanine--tRNA ligase beta subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSBQ9NSD9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FARSBQ9NSD9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms