Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX15Q9NRS6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX15Q9NRS6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX15Q9NRS6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX15Q9NRS6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX15Q9NRS6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX15Q9NRS6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX15Q9NRS6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX15Q9NRS6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX15Q9NRS6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX15Q9NRS6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX15Q9NRS6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX15Q9NRS6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX15Q9NRS6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX15Q9NRS6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX15Q9NRS6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX15Q9NRS6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX15Q9NRS6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX15Q9NRS6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX15Q9NRS6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX15Q9NRS6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX15Q9NRS6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX15Q9NRS6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX15Q9NRS6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX15Q9NRS6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX15Q9NRS6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX15Q9NRS6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX15Q9NRS6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX15Q9NRS6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX15Q9NRS6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX15Q9NRS6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX15Q9NRS6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX15Q9NRS6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX15Q9NRS6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX15Q9NRS6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX15Q9NRS6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX15Q9NRS6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX15Q9NRS6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX15Q9NRS6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX15Q9NRS6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX15Q9NRS6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX15Q9NRS6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX15Q9NRS6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX15Q9NRS6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX15Q9NRS6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX15Q9NRS6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX15Q9NRS6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX15Q9NRS6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX15Q9NRS6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX15Q9NRS6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX15Q9NRS6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX15Q9NRS6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX15Q9NRS6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX15Q9NRS6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX15Q9NRS6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX15Q9NRS6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX15Q9NRS6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX15Q9NRS6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX15Q9NRS6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX15Q9NRS6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX15Q9NRS6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX15Q9NRS6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX15Q9NRS6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX15Q9NRS6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX15Q9NRS6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX15Q9NRS6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX15Q9NRS6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SNX15Q9NRS6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms