Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GPHNQ9NQX3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GPHNQ9NQX3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GPHNQ9NQX3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
GPHNQ9NQX3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GPHNQ9NQX3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GPHNQ9NQX3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
GPHNQ9NQX3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GPHNQ9NQX3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
GPHNQ9NQX3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GPHNQ9NQX3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GPHNQ9NQX3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GPHNQ9NQX3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GPHNQ9NQX3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
GPHNQ9NQX3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GPHNQ9NQX3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GPHNQ9NQX3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
GPHNQ9NQX3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GPHNQ9NQX3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GPHNQ9NQX3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GPHNQ9NQX3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GPHNQ9NQX3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GPHNQ9NQX3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GPHNQ9NQX3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GPHNQ9NQX3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
GPHNQ9NQX3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GPHNQ9NQX3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GPHNQ9NQX3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GPHNQ9NQX3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GPHNQ9NQX3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GPHNQ9NQX3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GPHNQ9NQX3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
GPHNQ9NQX3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GPHNQ9NQX3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
GPHNQ9NQX3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GPHNQ9NQX3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GPHNQ9NQX3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GPHNQ9NQX3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GPHNQ9NQX3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
GPHNQ9NQX3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GPHNQ9NQX3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GPHNQ9NQX3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GPHNQ9NQX3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GPHNQ9NQX3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GPHNQ9NQX3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GPHNQ9NQX3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPHNQ9NQX3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPHNQ9NQX3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPHNQ9NQX3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPHNQ9NQX3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPHNQ9NQX3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPHNQ9NQX3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GPHNQ9NQX3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GPHNQ9NQX3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GPHNQ9NQX3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GPHNQ9NQX3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GPHNQ9NQX3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GPHNQ9NQX3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GPHNQ9NQX3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GPHNQ9NQX3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GPHNQ9NQX3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GPHNQ9NQX3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GPHNQ9NQX3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
GPHNQ9NQX3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPHNQ9NQX3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPHNQ9NQX3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPHNQ9NQX3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPHNQ9NQX3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPHNQ9NQX3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPHNQ9NQX3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPHNQ9NQX3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPHNQ9NQX3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPHNQ9NQX3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPHNQ9NQX3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GPHNQ9NQX3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GPHNQ9NQX3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPHNQ9NQX3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPHNQ9NQX3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPHNQ9NQX3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPHNQ9NQX3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPHNQ9NQX3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPHNQ9NQX3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPHNQ9NQX3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPHNQ9NQX3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPHNQ9NQX3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPHNQ9NQX3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPHNQ9NQX3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPHNQ9NQX3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPHNQ9NQX3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPHNQ9NQX3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPHNQ9NQX3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPHNQ9NQX3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPHNQ9NQX3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPHNQ9NQX3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPHNQ9NQX3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GPHNQ9NQX3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
GPHNQ9NQX3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GPHNQ9NQX3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GPHNQ9NQX3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GPHNQ9NQX3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms