Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ36

SCUBE2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCUBE2Q9NQ36 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCUBE2Q9NQ36 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCUBE2Q9NQ36 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCUBE2Q9NQ36 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCUBE2Q9NQ36 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCUBE2Q9NQ36 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCUBE2Q9NQ36 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCUBE2Q9NQ36 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCUBE2Q9NQ36 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCUBE2Q9NQ36 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCUBE2Q9NQ36 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCUBE2Q9NQ36 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCUBE2Q9NQ36 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCUBE2Q9NQ36 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCUBE2Q9NQ36 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCUBE2Q9NQ36 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCUBE2Q9NQ36 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCUBE2Q9NQ36 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCUBE2Q9NQ36 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCUBE2Q9NQ36 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCUBE2Q9NQ36 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCUBE2Q9NQ36 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCUBE2Q9NQ36 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCUBE2Q9NQ36 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCUBE2Q9NQ36 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SCUBE2Q9NQ36 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCUBE2Q9NQ36 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCUBE2Q9NQ36 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCUBE2Q9NQ36 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCUBE2Q9NQ36 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCUBE2Q9NQ36 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SCUBE2Q9NQ36 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCUBE2Q9NQ36 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCUBE2Q9NQ36 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCUBE2Q9NQ36 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCUBE2Q9NQ36 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCUBE2Q9NQ36 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCUBE2Q9NQ36 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCUBE2Q9NQ36 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCUBE2Q9NQ36 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCUBE2Q9NQ36 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCUBE2Q9NQ36 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SCUBE2Q9NQ36 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCUBE2Q9NQ36 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCUBE2Q9NQ36 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCUBE2Q9NQ36 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCUBE2Q9NQ36 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCUBE2Q9NQ36 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCUBE2Q9NQ36 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCUBE2Q9NQ36 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCUBE2Q9NQ36 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SCUBE2Q9NQ36 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCUBE2Q9NQ36 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCUBE2Q9NQ36 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCUBE2Q9NQ36 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCUBE2Q9NQ36 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCUBE2Q9NQ36 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCUBE2Q9NQ36 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SCUBE2Q9NQ36 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCUBE2Q9NQ36 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SCUBE2Q9NQ36 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCUBE2Q9NQ36 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCUBE2Q9NQ36 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCUBE2Q9NQ36 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCUBE2Q9NQ36 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCUBE2Q9NQ36 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCUBE2Q9NQ36 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCUBE2Q9NQ36 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCUBE2Q9NQ36 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCUBE2Q9NQ36 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCUBE2Q9NQ36 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCUBE2Q9NQ36 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCUBE2Q9NQ36 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCUBE2Q9NQ36 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCUBE2Q9NQ36 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCUBE2Q9NQ36 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCUBE2Q9NQ36 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCUBE2Q9NQ36 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCUBE2Q9NQ36 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCUBE2Q9NQ36 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SCUBE2Q9NQ36 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCUBE2Q9NQ36 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCUBE2Q9NQ36 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SCUBE2Q9NQ36 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SCUBE2Q9NQ36 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCUBE2Q9NQ36 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCUBE2Q9NQ36 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCUBE2Q9NQ36 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCUBE2Q9NQ36 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCUBE2Q9NQ36 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCUBE2Q9NQ36 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCUBE2Q9NQ36 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCUBE2Q9NQ36 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCUBE2Q9NQ36 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCUBE2Q9NQ36 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCUBE2Q9NQ36 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCUBE2Q9NQ36 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCUBE2Q9NQ36 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SCUBE2Q9NQ36 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms