Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG8

ZDHHC4, Probable palmitoyltransferase ZDHHC4, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC4Q9NPG8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZDHHC4Q9NPG8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZDHHC4Q9NPG8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ZDHHC4Q9NPG8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZDHHC4Q9NPG8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZDHHC4Q9NPG8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZDHHC4Q9NPG8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZDHHC4Q9NPG8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZDHHC4Q9NPG8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZDHHC4Q9NPG8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZDHHC4Q9NPG8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZDHHC4Q9NPG8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZDHHC4Q9NPG8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZDHHC4Q9NPG8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZDHHC4Q9NPG8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZDHHC4Q9NPG8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZDHHC4Q9NPG8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZDHHC4Q9NPG8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZDHHC4Q9NPG8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZDHHC4Q9NPG8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZDHHC4Q9NPG8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZDHHC4Q9NPG8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZDHHC4Q9NPG8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZDHHC4Q9NPG8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZDHHC4Q9NPG8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZDHHC4Q9NPG8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZDHHC4Q9NPG8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZDHHC4Q9NPG8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZDHHC4Q9NPG8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZDHHC4Q9NPG8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZDHHC4Q9NPG8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZDHHC4Q9NPG8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZDHHC4Q9NPG8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZDHHC4Q9NPG8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZDHHC4Q9NPG8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZDHHC4Q9NPG8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZDHHC4Q9NPG8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZDHHC4Q9NPG8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZDHHC4Q9NPG8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZDHHC4Q9NPG8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZDHHC4Q9NPG8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ZDHHC4Q9NPG8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZDHHC4Q9NPG8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZDHHC4Q9NPG8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZDHHC4Q9NPG8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZDHHC4Q9NPG8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZDHHC4Q9NPG8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZDHHC4Q9NPG8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZDHHC4Q9NPG8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZDHHC4Q9NPG8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZDHHC4Q9NPG8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZDHHC4Q9NPG8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZDHHC4Q9NPG8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZDHHC4Q9NPG8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZDHHC4Q9NPG8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZDHHC4Q9NPG8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZDHHC4Q9NPG8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZDHHC4Q9NPG8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZDHHC4Q9NPG8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZDHHC4Q9NPG8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZDHHC4Q9NPG8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZDHHC4Q9NPG8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZDHHC4Q9NPG8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZDHHC4Q9NPG8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZDHHC4Q9NPG8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZDHHC4Q9NPG8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZDHHC4Q9NPG8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZDHHC4Q9NPG8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZDHHC4Q9NPG8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZDHHC4Q9NPG8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZDHHC4Q9NPG8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZDHHC4Q9NPG8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZDHHC4Q9NPG8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZDHHC4Q9NPG8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZDHHC4Q9NPG8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZDHHC4Q9NPG8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZDHHC4Q9NPG8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZDHHC4Q9NPG8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZDHHC4Q9NPG8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZDHHC4Q9NPG8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZDHHC4Q9NPG8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZDHHC4Q9NPG8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZDHHC4Q9NPG8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZDHHC4Q9NPG8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZDHHC4Q9NPG8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZDHHC4Q9NPG8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZDHHC4Q9NPG8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZDHHC4Q9NPG8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZDHHC4Q9NPG8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZDHHC4Q9NPG8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZDHHC4Q9NPG8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZDHHC4Q9NPG8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZDHHC4Q9NPG8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZDHHC4Q9NPG8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZDHHC4Q9NPG8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZDHHC4Q9NPG8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZDHHC4Q9NPG8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZDHHC4Q9NPG8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZDHHC4Q9NPG8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZDHHC4Q9NPG8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms