Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
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KRTAP9-3Q9BYQ3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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KRTAP9-3Q9BYQ3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
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KRTAP9-3Q9BYQ3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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KRTAP9-3Q9BYQ3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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KRTAP9-3Q9BYQ3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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