Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWQ6

YIPF2, Protein YIPF2, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF2Q9BWQ6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
YIPF2Q9BWQ6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
YIPF2Q9BWQ6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
YIPF2Q9BWQ6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
YIPF2Q9BWQ6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
YIPF2Q9BWQ6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
YIPF2Q9BWQ6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
YIPF2Q9BWQ6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
YIPF2Q9BWQ6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
YIPF2Q9BWQ6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
YIPF2Q9BWQ6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
YIPF2Q9BWQ6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
YIPF2Q9BWQ6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
YIPF2Q9BWQ6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
YIPF2Q9BWQ6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
YIPF2Q9BWQ6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
YIPF2Q9BWQ6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
YIPF2Q9BWQ6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
YIPF2Q9BWQ6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
YIPF2Q9BWQ6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
YIPF2Q9BWQ6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
YIPF2Q9BWQ6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
YIPF2Q9BWQ6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
YIPF2Q9BWQ6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
YIPF2Q9BWQ6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
YIPF2Q9BWQ6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
YIPF2Q9BWQ6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
YIPF2Q9BWQ6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
YIPF2Q9BWQ6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
YIPF2Q9BWQ6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
YIPF2Q9BWQ6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
YIPF2Q9BWQ6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
YIPF2Q9BWQ6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
YIPF2Q9BWQ6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
YIPF2Q9BWQ6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
YIPF2Q9BWQ6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
YIPF2Q9BWQ6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
YIPF2Q9BWQ6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
YIPF2Q9BWQ6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
YIPF2Q9BWQ6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
YIPF2Q9BWQ6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
YIPF2Q9BWQ6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
YIPF2Q9BWQ6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
YIPF2Q9BWQ6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
YIPF2Q9BWQ6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
YIPF2Q9BWQ6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
YIPF2Q9BWQ6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
YIPF2Q9BWQ6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
YIPF2Q9BWQ6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
YIPF2Q9BWQ6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
YIPF2Q9BWQ6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
YIPF2Q9BWQ6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
YIPF2Q9BWQ6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
YIPF2Q9BWQ6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
YIPF2Q9BWQ6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
YIPF2Q9BWQ6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
YIPF2Q9BWQ6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
YIPF2Q9BWQ6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
YIPF2Q9BWQ6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
YIPF2Q9BWQ6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
YIPF2Q9BWQ6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
YIPF2Q9BWQ6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
YIPF2Q9BWQ6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
YIPF2Q9BWQ6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
YIPF2Q9BWQ6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
YIPF2Q9BWQ6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
YIPF2Q9BWQ6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
YIPF2Q9BWQ6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
YIPF2Q9BWQ6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
YIPF2Q9BWQ6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
YIPF2Q9BWQ6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
YIPF2Q9BWQ6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
YIPF2Q9BWQ6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
YIPF2Q9BWQ6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
YIPF2Q9BWQ6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
YIPF2Q9BWQ6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
YIPF2Q9BWQ6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
YIPF2Q9BWQ6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
YIPF2Q9BWQ6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
YIPF2Q9BWQ6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
YIPF2Q9BWQ6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
YIPF2Q9BWQ6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
YIPF2Q9BWQ6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
YIPF2Q9BWQ6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
YIPF2Q9BWQ6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
YIPF2Q9BWQ6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
YIPF2Q9BWQ6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
YIPF2Q9BWQ6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
YIPF2Q9BWQ6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
YIPF2Q9BWQ6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
YIPF2Q9BWQ6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
YIPF2Q9BWQ6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
YIPF2Q9BWQ6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
YIPF2Q9BWQ6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
YIPF2Q9BWQ6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
YIPF2Q9BWQ6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
YIPF2Q9BWQ6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
YIPF2Q9BWQ6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
YIPF2Q9BWQ6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
YIPF2Q9BWQ6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms