Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ61

C19orf43, Uncharacterized protein C19orf43, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf43Q9BQ61 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C19orf43Q9BQ61 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C19orf43Q9BQ61 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C19orf43Q9BQ61 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C19orf43Q9BQ61 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C19orf43Q9BQ61 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C19orf43Q9BQ61 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C19orf43Q9BQ61 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C19orf43Q9BQ61 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C19orf43Q9BQ61 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C19orf43Q9BQ61 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C19orf43Q9BQ61 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C19orf43Q9BQ61 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C19orf43Q9BQ61 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C19orf43Q9BQ61 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C19orf43Q9BQ61 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C19orf43Q9BQ61 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C19orf43Q9BQ61 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C19orf43Q9BQ61 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C19orf43Q9BQ61 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C19orf43Q9BQ61 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C19orf43Q9BQ61 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C19orf43Q9BQ61 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C19orf43Q9BQ61 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C19orf43Q9BQ61 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C19orf43Q9BQ61 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C19orf43Q9BQ61 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C19orf43Q9BQ61 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C19orf43Q9BQ61 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C19orf43Q9BQ61 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C19orf43Q9BQ61 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
C19orf43Q9BQ61 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C19orf43Q9BQ61 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C19orf43Q9BQ61 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C19orf43Q9BQ61 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C19orf43Q9BQ61 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C19orf43Q9BQ61 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C19orf43Q9BQ61 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C19orf43Q9BQ61 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C19orf43Q9BQ61 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C19orf43Q9BQ61 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C19orf43Q9BQ61 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C19orf43Q9BQ61 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C19orf43Q9BQ61 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C19orf43Q9BQ61 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C19orf43Q9BQ61 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C19orf43Q9BQ61 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C19orf43Q9BQ61 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C19orf43Q9BQ61 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C19orf43Q9BQ61 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C19orf43Q9BQ61 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C19orf43Q9BQ61 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C19orf43Q9BQ61 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C19orf43Q9BQ61 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C19orf43Q9BQ61 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C19orf43Q9BQ61 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C19orf43Q9BQ61 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C19orf43Q9BQ61 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C19orf43Q9BQ61 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C19orf43Q9BQ61 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C19orf43Q9BQ61 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C19orf43Q9BQ61 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C19orf43Q9BQ61 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C19orf43Q9BQ61 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C19orf43Q9BQ61 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C19orf43Q9BQ61 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C19orf43Q9BQ61 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C19orf43Q9BQ61 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C19orf43Q9BQ61 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C19orf43Q9BQ61 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C19orf43Q9BQ61 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C19orf43Q9BQ61 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C19orf43Q9BQ61 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C19orf43Q9BQ61 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C19orf43Q9BQ61 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C19orf43Q9BQ61 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
C19orf43Q9BQ61 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C19orf43Q9BQ61 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C19orf43Q9BQ61 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C19orf43Q9BQ61 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C19orf43Q9BQ61 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
C19orf43Q9BQ61 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C19orf43Q9BQ61 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C19orf43Q9BQ61 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
C19orf43Q9BQ61 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C19orf43Q9BQ61 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C19orf43Q9BQ61 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C19orf43Q9BQ61 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C19orf43Q9BQ61 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C19orf43Q9BQ61 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C19orf43Q9BQ61 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C19orf43Q9BQ61 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C19orf43Q9BQ61 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C19orf43Q9BQ61 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
C19orf43Q9BQ61 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C19orf43Q9BQ61 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C19orf43Q9BQ61 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C19orf43Q9BQ61 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C19orf43Q9BQ61 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C19orf43Q9BQ61 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms