Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CCDC7Q96M83 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
CCDC7Q96M83 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
CCDC7Q96M83 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CCDC7Q96M83 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CCDC7Q96M83 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CCDC7Q96M83 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CCDC7Q96M83 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CCDC7Q96M83 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CCDC7Q96M83 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CCDC7Q96M83 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CCDC7Q96M83 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CCDC7Q96M83 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CCDC7Q96M83 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CCDC7Q96M83 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CCDC7Q96M83 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CCDC7Q96M83 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CCDC7Q96M83 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CCDC7Q96M83 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CCDC7Q96M83 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CCDC7Q96M83 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CCDC7Q96M83 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CCDC7Q96M83 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CCDC7Q96M83 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CCDC7Q96M83 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CCDC7Q96M83 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CCDC7Q96M83 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CCDC7Q96M83 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CCDC7Q96M83 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CCDC7Q96M83 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CCDC7Q96M83 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CCDC7Q96M83 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CCDC7Q96M83 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CCDC7Q96M83 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CCDC7Q96M83 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CCDC7Q96M83 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CCDC7Q96M83 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CCDC7Q96M83 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CCDC7Q96M83 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CCDC7Q96M83 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CCDC7Q96M83 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CCDC7Q96M83 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CCDC7Q96M83 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CCDC7Q96M83 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CCDC7Q96M83 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CCDC7Q96M83 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CCDC7Q96M83 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CCDC7Q96M83 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
CCDC7Q96M83 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CCDC7Q96M83 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CCDC7Q96M83 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
CCDC7Q96M83 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CCDC7Q96M83 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CCDC7Q96M83 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CCDC7Q96M83 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CCDC7Q96M83 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CCDC7Q96M83 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CCDC7Q96M83 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CCDC7Q96M83 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CCDC7Q96M83 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
CCDC7Q96M83 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
CCDC7Q96M83 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CCDC7Q96M83 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CCDC7Q96M83 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CCDC7Q96M83 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CCDC7Q96M83 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CCDC7Q96M83 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CCDC7Q96M83 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CCDC7Q96M83 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CCDC7Q96M83 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CCDC7Q96M83 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CCDC7Q96M83 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CCDC7Q96M83 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
CCDC7Q96M83 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CCDC7Q96M83 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CCDC7Q96M83 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CCDC7Q96M83 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CCDC7Q96M83 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CCDC7Q96M83 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC7Q96M83 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC7Q96M83 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC7Q96M83 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC7Q96M83 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC7Q96M83 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC7Q96M83 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC7Q96M83 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC7Q96M83 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC7Q96M83 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CCDC7Q96M83 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
CCDC7Q96M83 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CCDC7Q96M83 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CCDC7Q96M83 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CCDC7Q96M83 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CCDC7Q96M83 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CCDC7Q96M83 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CCDC7Q96M83 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CCDC7Q96M83 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC7Q96M83 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC7Q96M83 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC7Q96M83 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms