Protein–RNA interactions for Protein: Q96CT2

KLHL29, Kelch-like protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL29Q96CT2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL29Q96CT2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL29Q96CT2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL29Q96CT2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL29Q96CT2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL29Q96CT2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL29Q96CT2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL29Q96CT2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL29Q96CT2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL29Q96CT2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL29Q96CT2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL29Q96CT2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL29Q96CT2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL29Q96CT2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL29Q96CT2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL29Q96CT2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL29Q96CT2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL29Q96CT2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL29Q96CT2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL29Q96CT2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL29Q96CT2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL29Q96CT2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL29Q96CT2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL29Q96CT2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL29Q96CT2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL29Q96CT2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL29Q96CT2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL29Q96CT2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL29Q96CT2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL29Q96CT2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL29Q96CT2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL29Q96CT2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL29Q96CT2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL29Q96CT2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL29Q96CT2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL29Q96CT2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL29Q96CT2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL29Q96CT2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL29Q96CT2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL29Q96CT2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL29Q96CT2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL29Q96CT2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL29Q96CT2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL29Q96CT2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms