Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF34Q969K3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF34Q969K3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF34Q969K3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF34Q969K3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF34Q969K3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF34Q969K3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF34Q969K3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF34Q969K3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF34Q969K3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF34Q969K3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF34Q969K3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF34Q969K3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF34Q969K3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF34Q969K3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF34Q969K3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF34Q969K3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF34Q969K3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF34Q969K3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF34Q969K3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF34Q969K3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF34Q969K3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF34Q969K3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF34Q969K3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF34Q969K3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF34Q969K3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF34Q969K3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF34Q969K3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF34Q969K3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF34Q969K3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF34Q969K3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF34Q969K3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF34Q969K3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF34Q969K3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF34Q969K3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF34Q969K3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF34Q969K3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF34Q969K3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF34Q969K3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF34Q969K3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF34Q969K3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF34Q969K3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF34Q969K3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF34Q969K3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF34Q969K3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RNF34Q969K3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RNF34Q969K3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RNF34Q969K3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF34Q969K3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF34Q969K3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF34Q969K3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF34Q969K3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF34Q969K3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF34Q969K3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF34Q969K3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF34Q969K3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF34Q969K3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF34Q969K3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF34Q969K3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF34Q969K3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF34Q969K3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF34Q969K3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF34Q969K3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF34Q969K3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF34Q969K3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF34Q969K3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF34Q969K3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF34Q969K3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF34Q969K3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF34Q969K3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF34Q969K3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF34Q969K3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF34Q969K3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF34Q969K3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF34Q969K3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF34Q969K3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF34Q969K3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF34Q969K3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF34Q969K3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF34Q969K3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF34Q969K3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF34Q969K3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF34Q969K3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF34Q969K3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF34Q969K3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF34Q969K3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF34Q969K3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF34Q969K3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF34Q969K3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF34Q969K3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF34Q969K3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF34Q969K3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF34Q969K3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF34Q969K3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF34Q969K3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF34Q969K3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF34Q969K3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF34Q969K3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF34Q969K3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF34Q969K3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms