Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GATA6Q92908 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GATA6Q92908 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GATA6Q92908 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GATA6Q92908 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GATA6Q92908 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GATA6Q92908 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GATA6Q92908 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GATA6Q92908 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GATA6Q92908 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GATA6Q92908 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GATA6Q92908 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GATA6Q92908 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GATA6Q92908 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GATA6Q92908 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GATA6Q92908 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GATA6Q92908 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms