Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF3AQ92664 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
GTF3AQ92664 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GTF3AQ92664 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF3AQ92664 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF3AQ92664 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF3AQ92664 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF3AQ92664 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF3AQ92664 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF3AQ92664 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF3AQ92664 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF3AQ92664 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF3AQ92664 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF3AQ92664 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF3AQ92664 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF3AQ92664 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF3AQ92664 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF3AQ92664 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF3AQ92664 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF3AQ92664 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF3AQ92664 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF3AQ92664 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF3AQ92664 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF3AQ92664 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF3AQ92664 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF3AQ92664 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF3AQ92664 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF3AQ92664 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF3AQ92664 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF3AQ92664 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF3AQ92664 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF3AQ92664 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF3AQ92664 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF3AQ92664 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF3AQ92664 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF3AQ92664 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF3AQ92664 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF3AQ92664 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF3AQ92664 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF3AQ92664 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF3AQ92664 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF3AQ92664 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF3AQ92664 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF3AQ92664 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF3AQ92664 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF3AQ92664 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF3AQ92664 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF3AQ92664 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF3AQ92664 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF3AQ92664 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF3AQ92664 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF3AQ92664 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF3AQ92664 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF3AQ92664 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF3AQ92664 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF3AQ92664 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF3AQ92664 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF3AQ92664 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF3AQ92664 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms