Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVJ9

TWIST2, Twist-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST2Q8WVJ9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TWIST2Q8WVJ9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TWIST2Q8WVJ9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms