Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC12Q8WUD4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC12Q8WUD4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC12Q8WUD4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC12Q8WUD4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC12Q8WUD4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC12Q8WUD4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC12Q8WUD4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC12Q8WUD4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC12Q8WUD4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC12Q8WUD4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC12Q8WUD4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC12Q8WUD4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC12Q8WUD4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC12Q8WUD4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC12Q8WUD4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC12Q8WUD4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC12Q8WUD4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC12Q8WUD4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC12Q8WUD4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC12Q8WUD4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC12Q8WUD4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC12Q8WUD4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC12Q8WUD4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC12Q8WUD4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC12Q8WUD4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC12Q8WUD4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC12Q8WUD4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC12Q8WUD4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC12Q8WUD4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC12Q8WUD4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC12Q8WUD4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC12Q8WUD4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC12Q8WUD4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC12Q8WUD4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC12Q8WUD4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC12Q8WUD4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC12Q8WUD4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC12Q8WUD4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC12Q8WUD4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC12Q8WUD4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC12Q8WUD4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC12Q8WUD4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC12Q8WUD4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC12Q8WUD4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC12Q8WUD4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC12Q8WUD4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC12Q8WUD4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC12Q8WUD4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC12Q8WUD4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC12Q8WUD4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC12Q8WUD4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC12Q8WUD4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC12Q8WUD4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC12Q8WUD4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC12Q8WUD4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC12Q8WUD4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC12Q8WUD4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC12Q8WUD4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC12Q8WUD4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC12Q8WUD4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC12Q8WUD4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC12Q8WUD4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC12Q8WUD4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC12Q8WUD4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CCDC12Q8WUD4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC12Q8WUD4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC12Q8WUD4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC12Q8WUD4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC12Q8WUD4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC12Q8WUD4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC12Q8WUD4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC12Q8WUD4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC12Q8WUD4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC12Q8WUD4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC12Q8WUD4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC12Q8WUD4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC12Q8WUD4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC12Q8WUD4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC12Q8WUD4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC12Q8WUD4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC12Q8WUD4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC12Q8WUD4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC12Q8WUD4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC12Q8WUD4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC12Q8WUD4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC12Q8WUD4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC12Q8WUD4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC12Q8WUD4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC12Q8WUD4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC12Q8WUD4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC12Q8WUD4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC12Q8WUD4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC12Q8WUD4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC12Q8WUD4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC12Q8WUD4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC12Q8WUD4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC12Q8WUD4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC12Q8WUD4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC12Q8WUD4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms