Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD53Q8N9V6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD53Q8N9V6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD53Q8N9V6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD53Q8N9V6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD53Q8N9V6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD53Q8N9V6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD53Q8N9V6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD53Q8N9V6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD53Q8N9V6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD53Q8N9V6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD53Q8N9V6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD53Q8N9V6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD53Q8N9V6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD53Q8N9V6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD53Q8N9V6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD53Q8N9V6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD53Q8N9V6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD53Q8N9V6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD53Q8N9V6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD53Q8N9V6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD53Q8N9V6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD53Q8N9V6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD53Q8N9V6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD53Q8N9V6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD53Q8N9V6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD53Q8N9V6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD53Q8N9V6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD53Q8N9V6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD53Q8N9V6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD53Q8N9V6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD53Q8N9V6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ANKRD53Q8N9V6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD53Q8N9V6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD53Q8N9V6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD53Q8N9V6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD53Q8N9V6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD53Q8N9V6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD53Q8N9V6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD53Q8N9V6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD53Q8N9V6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD53Q8N9V6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD53Q8N9V6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD53Q8N9V6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD53Q8N9V6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD53Q8N9V6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD53Q8N9V6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD53Q8N9V6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD53Q8N9V6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD53Q8N9V6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD53Q8N9V6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD53Q8N9V6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD53Q8N9V6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD53Q8N9V6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD53Q8N9V6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD53Q8N9V6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD53Q8N9V6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD53Q8N9V6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD53Q8N9V6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD53Q8N9V6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD53Q8N9V6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD53Q8N9V6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD53Q8N9V6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD53Q8N9V6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKRD53Q8N9V6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD53Q8N9V6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD53Q8N9V6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD53Q8N9V6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD53Q8N9V6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD53Q8N9V6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD53Q8N9V6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD53Q8N9V6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKRD53Q8N9V6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD53Q8N9V6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD53Q8N9V6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD53Q8N9V6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ANKRD53Q8N9V6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD53Q8N9V6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD53Q8N9V6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD53Q8N9V6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD53Q8N9V6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD53Q8N9V6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD53Q8N9V6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD53Q8N9V6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD53Q8N9V6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD53Q8N9V6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD53Q8N9V6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD53Q8N9V6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD53Q8N9V6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD53Q8N9V6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD53Q8N9V6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD53Q8N9V6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD53Q8N9V6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD53Q8N9V6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD53Q8N9V6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ANKRD53Q8N9V6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ANKRD53Q8N9V6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ANKRD53Q8N9V6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ANKRD53Q8N9V6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ANKRD53Q8N9V6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms