Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Q1

FAM71E2, Protein FAM71E2, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71E2Q8N5Q1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM71E2Q8N5Q1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM71E2Q8N5Q1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM71E2Q8N5Q1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM71E2Q8N5Q1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM71E2Q8N5Q1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM71E2Q8N5Q1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM71E2Q8N5Q1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM71E2Q8N5Q1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM71E2Q8N5Q1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM71E2Q8N5Q1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM71E2Q8N5Q1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM71E2Q8N5Q1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM71E2Q8N5Q1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM71E2Q8N5Q1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM71E2Q8N5Q1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM71E2Q8N5Q1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM71E2Q8N5Q1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM71E2Q8N5Q1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM71E2Q8N5Q1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM71E2Q8N5Q1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM71E2Q8N5Q1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM71E2Q8N5Q1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM71E2Q8N5Q1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM71E2Q8N5Q1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM71E2Q8N5Q1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM71E2Q8N5Q1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM71E2Q8N5Q1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM71E2Q8N5Q1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM71E2Q8N5Q1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM71E2Q8N5Q1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM71E2Q8N5Q1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM71E2Q8N5Q1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM71E2Q8N5Q1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM71E2Q8N5Q1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM71E2Q8N5Q1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM71E2Q8N5Q1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM71E2Q8N5Q1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM71E2Q8N5Q1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM71E2Q8N5Q1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM71E2Q8N5Q1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM71E2Q8N5Q1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM71E2Q8N5Q1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM71E2Q8N5Q1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM71E2Q8N5Q1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM71E2Q8N5Q1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71E2Q8N5Q1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71E2Q8N5Q1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71E2Q8N5Q1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71E2Q8N5Q1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71E2Q8N5Q1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71E2Q8N5Q1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71E2Q8N5Q1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71E2Q8N5Q1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71E2Q8N5Q1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71E2Q8N5Q1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71E2Q8N5Q1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71E2Q8N5Q1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71E2Q8N5Q1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71E2Q8N5Q1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71E2Q8N5Q1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM71E2Q8N5Q1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM71E2Q8N5Q1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM71E2Q8N5Q1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM71E2Q8N5Q1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM71E2Q8N5Q1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM71E2Q8N5Q1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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FAM71E2Q8N5Q1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM71E2Q8N5Q1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM71E2Q8N5Q1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM71E2Q8N5Q1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM71E2Q8N5Q1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM71E2Q8N5Q1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM71E2Q8N5Q1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM71E2Q8N5Q1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM71E2Q8N5Q1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM71E2Q8N5Q1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM71E2Q8N5Q1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM71E2Q8N5Q1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM71E2Q8N5Q1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM71E2Q8N5Q1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM71E2Q8N5Q1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM71E2Q8N5Q1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM71E2Q8N5Q1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM71E2Q8N5Q1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM71E2Q8N5Q1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM71E2Q8N5Q1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM71E2Q8N5Q1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM71E2Q8N5Q1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM71E2Q8N5Q1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM71E2Q8N5Q1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM71E2Q8N5Q1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM71E2Q8N5Q1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM71E2Q8N5Q1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM71E2Q8N5Q1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM71E2Q8N5Q1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM71E2Q8N5Q1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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