Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW8

SPNS2, Protein spinster homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2Q8IVW8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPNS2Q8IVW8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPNS2Q8IVW8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPNS2Q8IVW8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPNS2Q8IVW8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPNS2Q8IVW8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPNS2Q8IVW8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPNS2Q8IVW8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPNS2Q8IVW8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPNS2Q8IVW8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPNS2Q8IVW8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SPNS2Q8IVW8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPNS2Q8IVW8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPNS2Q8IVW8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPNS2Q8IVW8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPNS2Q8IVW8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPNS2Q8IVW8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPNS2Q8IVW8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPNS2Q8IVW8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SPNS2Q8IVW8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPNS2Q8IVW8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPNS2Q8IVW8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPNS2Q8IVW8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPNS2Q8IVW8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPNS2Q8IVW8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPNS2Q8IVW8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPNS2Q8IVW8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPNS2Q8IVW8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPNS2Q8IVW8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPNS2Q8IVW8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPNS2Q8IVW8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPNS2Q8IVW8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPNS2Q8IVW8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPNS2Q8IVW8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPNS2Q8IVW8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPNS2Q8IVW8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPNS2Q8IVW8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SPNS2Q8IVW8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SPNS2Q8IVW8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPNS2Q8IVW8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPNS2Q8IVW8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPNS2Q8IVW8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPNS2Q8IVW8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SPNS2Q8IVW8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPNS2Q8IVW8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPNS2Q8IVW8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPNS2Q8IVW8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPNS2Q8IVW8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPNS2Q8IVW8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPNS2Q8IVW8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPNS2Q8IVW8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPNS2Q8IVW8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPNS2Q8IVW8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPNS2Q8IVW8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPNS2Q8IVW8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPNS2Q8IVW8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPNS2Q8IVW8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPNS2Q8IVW8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPNS2Q8IVW8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPNS2Q8IVW8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPNS2Q8IVW8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPNS2Q8IVW8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPNS2Q8IVW8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPNS2Q8IVW8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SPNS2Q8IVW8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPNS2Q8IVW8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPNS2Q8IVW8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPNS2Q8IVW8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPNS2Q8IVW8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPNS2Q8IVW8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPNS2Q8IVW8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPNS2Q8IVW8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPNS2Q8IVW8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPNS2Q8IVW8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPNS2Q8IVW8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPNS2Q8IVW8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPNS2Q8IVW8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPNS2Q8IVW8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPNS2Q8IVW8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPNS2Q8IVW8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPNS2Q8IVW8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SPNS2Q8IVW8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPNS2Q8IVW8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SPNS2Q8IVW8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SPNS2Q8IVW8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPNS2Q8IVW8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPNS2Q8IVW8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPNS2Q8IVW8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPNS2Q8IVW8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPNS2Q8IVW8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPNS2Q8IVW8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPNS2Q8IVW8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPNS2Q8IVW8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPNS2Q8IVW8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPNS2Q8IVW8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPNS2Q8IVW8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPNS2Q8IVW8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPNS2Q8IVW8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPNS2Q8IVW8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPNS2Q8IVW8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms