Protein–RNA interactions for Protein: Q86WP2

GPBP1, Vasculin, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1Q86WP2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPBP1Q86WP2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPBP1Q86WP2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPBP1Q86WP2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPBP1Q86WP2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPBP1Q86WP2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPBP1Q86WP2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPBP1Q86WP2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPBP1Q86WP2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPBP1Q86WP2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GPBP1Q86WP2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GPBP1Q86WP2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GPBP1Q86WP2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPBP1Q86WP2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPBP1Q86WP2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPBP1Q86WP2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPBP1Q86WP2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPBP1Q86WP2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPBP1Q86WP2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GPBP1Q86WP2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPBP1Q86WP2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPBP1Q86WP2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPBP1Q86WP2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPBP1Q86WP2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPBP1Q86WP2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPBP1Q86WP2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPBP1Q86WP2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPBP1Q86WP2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPBP1Q86WP2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPBP1Q86WP2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPBP1Q86WP2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPBP1Q86WP2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPBP1Q86WP2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPBP1Q86WP2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPBP1Q86WP2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPBP1Q86WP2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GPBP1Q86WP2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPBP1Q86WP2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPBP1Q86WP2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPBP1Q86WP2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPBP1Q86WP2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPBP1Q86WP2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPBP1Q86WP2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPBP1Q86WP2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPBP1Q86WP2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPBP1Q86WP2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPBP1Q86WP2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GPBP1Q86WP2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPBP1Q86WP2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPBP1Q86WP2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPBP1Q86WP2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPBP1Q86WP2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPBP1Q86WP2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPBP1Q86WP2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPBP1Q86WP2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPBP1Q86WP2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPBP1Q86WP2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPBP1Q86WP2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GPBP1Q86WP2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPBP1Q86WP2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPBP1Q86WP2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPBP1Q86WP2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPBP1Q86WP2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPBP1Q86WP2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPBP1Q86WP2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPBP1Q86WP2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPBP1Q86WP2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPBP1Q86WP2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GPBP1Q86WP2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GPBP1Q86WP2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GPBP1Q86WP2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GPBP1Q86WP2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GPBP1Q86WP2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GPBP1Q86WP2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GPBP1Q86WP2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GPBP1Q86WP2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPBP1Q86WP2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPBP1Q86WP2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPBP1Q86WP2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPBP1Q86WP2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GPBP1Q86WP2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GPBP1Q86WP2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPBP1Q86WP2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPBP1Q86WP2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPBP1Q86WP2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPBP1Q86WP2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPBP1Q86WP2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPBP1Q86WP2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GPBP1Q86WP2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPBP1Q86WP2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPBP1Q86WP2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPBP1Q86WP2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPBP1Q86WP2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPBP1Q86WP2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPBP1Q86WP2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPBP1Q86WP2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPBP1Q86WP2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPBP1Q86WP2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPBP1Q86WP2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPBP1Q86WP2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms