Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNMB4Q86W47 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNMB4Q86W47 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNMB4Q86W47 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNMB4Q86W47 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNMB4Q86W47 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNMB4Q86W47 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNMB4Q86W47 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNMB4Q86W47 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNMB4Q86W47 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNMB4Q86W47 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNMB4Q86W47 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNMB4Q86W47 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNMB4Q86W47 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNMB4Q86W47 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNMB4Q86W47 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNMB4Q86W47 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNMB4Q86W47 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNMB4Q86W47 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNMB4Q86W47 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNMB4Q86W47 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNMB4Q86W47 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNMB4Q86W47 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNMB4Q86W47 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNMB4Q86W47 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNMB4Q86W47 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNMB4Q86W47 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNMB4Q86W47 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNMB4Q86W47 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNMB4Q86W47 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNMB4Q86W47 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNMB4Q86W47 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNMB4Q86W47 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNMB4Q86W47 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNMB4Q86W47 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNMB4Q86W47 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNMB4Q86W47 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNMB4Q86W47 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNMB4Q86W47 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNMB4Q86W47 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNMB4Q86W47 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNMB4Q86W47 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNMB4Q86W47 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNMB4Q86W47 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNMB4Q86W47 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNMB4Q86W47 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNMB4Q86W47 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNMB4Q86W47 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNMB4Q86W47 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNMB4Q86W47 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNMB4Q86W47 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNMB4Q86W47 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNMB4Q86W47 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNMB4Q86W47 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNMB4Q86W47 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNMB4Q86W47 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNMB4Q86W47 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNMB4Q86W47 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNMB4Q86W47 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNMB4Q86W47 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNMB4Q86W47 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNMB4Q86W47 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNMB4Q86W47 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNMB4Q86W47 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNMB4Q86W47 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNMB4Q86W47 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNMB4Q86W47 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNMB4Q86W47 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNMB4Q86W47 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNMB4Q86W47 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNMB4Q86W47 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNMB4Q86W47 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNMB4Q86W47 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNMB4Q86W47 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNMB4Q86W47 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNMB4Q86W47 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNMB4Q86W47 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNMB4Q86W47 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNMB4Q86W47 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNMB4Q86W47 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNMB4Q86W47 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNMB4Q86W47 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNMB4Q86W47 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNMB4Q86W47 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNMB4Q86W47 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNMB4Q86W47 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNMB4Q86W47 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNMB4Q86W47 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNMB4Q86W47 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNMB4Q86W47 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNMB4Q86W47 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNMB4Q86W47 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNMB4Q86W47 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNMB4Q86W47 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNMB4Q86W47 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNMB4Q86W47 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNMB4Q86W47 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNMB4Q86W47 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNMB4Q86W47 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNMB4Q86W47 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms