Protein–RNA interactions for Protein: Q86T82

USP37, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 37, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP37Q86T82 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP37Q86T82 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP37Q86T82 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP37Q86T82 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP37Q86T82 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP37Q86T82 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP37Q86T82 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP37Q86T82 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP37Q86T82 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP37Q86T82 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP37Q86T82 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP37Q86T82 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP37Q86T82 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP37Q86T82 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP37Q86T82 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP37Q86T82 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP37Q86T82 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP37Q86T82 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP37Q86T82 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
USP37Q86T82 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
USP37Q86T82 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP37Q86T82 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP37Q86T82 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP37Q86T82 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP37Q86T82 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP37Q86T82 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP37Q86T82 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP37Q86T82 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP37Q86T82 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP37Q86T82 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP37Q86T82 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP37Q86T82 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP37Q86T82 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
USP37Q86T82 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP37Q86T82 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP37Q86T82 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP37Q86T82 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP37Q86T82 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP37Q86T82 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP37Q86T82 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP37Q86T82 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP37Q86T82 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP37Q86T82 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP37Q86T82 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP37Q86T82 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP37Q86T82 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP37Q86T82 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP37Q86T82 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP37Q86T82 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP37Q86T82 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP37Q86T82 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP37Q86T82 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP37Q86T82 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP37Q86T82 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP37Q86T82 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP37Q86T82 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP37Q86T82 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP37Q86T82 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP37Q86T82 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP37Q86T82 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP37Q86T82 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP37Q86T82 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP37Q86T82 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP37Q86T82 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP37Q86T82 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP37Q86T82 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP37Q86T82 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP37Q86T82 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP37Q86T82 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP37Q86T82 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP37Q86T82 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP37Q86T82 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP37Q86T82 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
USP37Q86T82 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP37Q86T82 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
USP37Q86T82 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP37Q86T82 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP37Q86T82 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP37Q86T82 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP37Q86T82 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP37Q86T82 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
USP37Q86T82 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP37Q86T82 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP37Q86T82 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP37Q86T82 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP37Q86T82 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP37Q86T82 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
USP37Q86T82 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
USP37Q86T82 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
USP37Q86T82 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP37Q86T82 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP37Q86T82 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP37Q86T82 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP37Q86T82 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP37Q86T82 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP37Q86T82 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP37Q86T82 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP37Q86T82 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP37Q86T82 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP37Q86T82 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms