Protein–RNA interactions for Protein: Q68DV7

RNF43, E3 ubiquitin-protein ligase RNF43, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF43Q68DV7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF43Q68DV7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF43Q68DV7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF43Q68DV7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF43Q68DV7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF43Q68DV7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF43Q68DV7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF43Q68DV7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF43Q68DV7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF43Q68DV7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF43Q68DV7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF43Q68DV7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF43Q68DV7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF43Q68DV7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF43Q68DV7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF43Q68DV7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF43Q68DV7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF43Q68DV7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF43Q68DV7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF43Q68DV7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF43Q68DV7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF43Q68DV7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF43Q68DV7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF43Q68DV7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF43Q68DV7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF43Q68DV7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF43Q68DV7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF43Q68DV7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF43Q68DV7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF43Q68DV7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF43Q68DV7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF43Q68DV7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF43Q68DV7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF43Q68DV7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF43Q68DV7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF43Q68DV7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF43Q68DV7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF43Q68DV7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF43Q68DV7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF43Q68DV7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF43Q68DV7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF43Q68DV7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF43Q68DV7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF43Q68DV7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF43Q68DV7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF43Q68DV7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF43Q68DV7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF43Q68DV7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF43Q68DV7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF43Q68DV7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF43Q68DV7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF43Q68DV7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF43Q68DV7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF43Q68DV7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF43Q68DV7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF43Q68DV7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF43Q68DV7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF43Q68DV7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF43Q68DV7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF43Q68DV7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF43Q68DV7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF43Q68DV7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF43Q68DV7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF43Q68DV7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF43Q68DV7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF43Q68DV7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF43Q68DV7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF43Q68DV7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF43Q68DV7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF43Q68DV7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF43Q68DV7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF43Q68DV7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF43Q68DV7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF43Q68DV7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF43Q68DV7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF43Q68DV7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF43Q68DV7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF43Q68DV7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF43Q68DV7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF43Q68DV7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF43Q68DV7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF43Q68DV7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF43Q68DV7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF43Q68DV7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF43Q68DV7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF43Q68DV7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF43Q68DV7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF43Q68DV7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF43Q68DV7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF43Q68DV7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF43Q68DV7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF43Q68DV7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF43Q68DV7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF43Q68DV7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF43Q68DV7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF43Q68DV7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF43Q68DV7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF43Q68DV7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF43Q68DV7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF43Q68DV7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms