Protein–RNA interactions for Protein: Q5TIE3

VWA5B1, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B1, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA5B1Q5TIE3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VWA5B1Q5TIE3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VWA5B1Q5TIE3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VWA5B1Q5TIE3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VWA5B1Q5TIE3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VWA5B1Q5TIE3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VWA5B1Q5TIE3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VWA5B1Q5TIE3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VWA5B1Q5TIE3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VWA5B1Q5TIE3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VWA5B1Q5TIE3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VWA5B1Q5TIE3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VWA5B1Q5TIE3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VWA5B1Q5TIE3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VWA5B1Q5TIE3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VWA5B1Q5TIE3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VWA5B1Q5TIE3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VWA5B1Q5TIE3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VWA5B1Q5TIE3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VWA5B1Q5TIE3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VWA5B1Q5TIE3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VWA5B1Q5TIE3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
VWA5B1Q5TIE3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VWA5B1Q5TIE3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VWA5B1Q5TIE3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VWA5B1Q5TIE3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VWA5B1Q5TIE3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms