Protein–RNA interactions for Protein: Q5EB52

MEST, Mesoderm-specific transcript homolog protein, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESTQ5EB52 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MESTQ5EB52 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MESTQ5EB52 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MESTQ5EB52 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MESTQ5EB52 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MESTQ5EB52 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MESTQ5EB52 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MESTQ5EB52 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MESTQ5EB52 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MESTQ5EB52 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MESTQ5EB52 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MESTQ5EB52 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MESTQ5EB52 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MESTQ5EB52 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MESTQ5EB52 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
MESTQ5EB52 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MESTQ5EB52 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MESTQ5EB52 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MESTQ5EB52 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MESTQ5EB52 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MESTQ5EB52 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MESTQ5EB52 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MESTQ5EB52 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MESTQ5EB52 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MESTQ5EB52 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MESTQ5EB52 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MESTQ5EB52 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MESTQ5EB52 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MESTQ5EB52 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MESTQ5EB52 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MESTQ5EB52 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MESTQ5EB52 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MESTQ5EB52 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MESTQ5EB52 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MESTQ5EB52 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MESTQ5EB52 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MESTQ5EB52 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
MESTQ5EB52 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MESTQ5EB52 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MESTQ5EB52 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MESTQ5EB52 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MESTQ5EB52 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MESTQ5EB52 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
MESTQ5EB52 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
MESTQ5EB52 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
MESTQ5EB52 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MESTQ5EB52 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MESTQ5EB52 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MESTQ5EB52 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MESTQ5EB52 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MESTQ5EB52 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MESTQ5EB52 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MESTQ5EB52 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MESTQ5EB52 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MESTQ5EB52 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MESTQ5EB52 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MESTQ5EB52 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MESTQ5EB52 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MESTQ5EB52 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MESTQ5EB52 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MESTQ5EB52 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MESTQ5EB52 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MESTQ5EB52 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MESTQ5EB52 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MESTQ5EB52 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MESTQ5EB52 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MESTQ5EB52 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MESTQ5EB52 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MESTQ5EB52 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MESTQ5EB52 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MESTQ5EB52 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MESTQ5EB52 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MESTQ5EB52 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MESTQ5EB52 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MESTQ5EB52 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MESTQ5EB52 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MESTQ5EB52 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MESTQ5EB52 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MESTQ5EB52 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MESTQ5EB52 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MESTQ5EB52 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MESTQ5EB52 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MESTQ5EB52 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MESTQ5EB52 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
MESTQ5EB52 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MESTQ5EB52 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MESTQ5EB52 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MESTQ5EB52 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MESTQ5EB52 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MESTQ5EB52 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MESTQ5EB52 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MESTQ5EB52 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MESTQ5EB52 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
MESTQ5EB52 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MESTQ5EB52 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
MESTQ5EB52 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MESTQ5EB52 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
MESTQ5EB52 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MESTQ5EB52 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MESTQ5EB52 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms