Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZIC1Q15915 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
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