Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC30.02■■■□□ 2.4
VPS72Q15906 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
VPS72Q15906 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
VPS72Q15906 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
VPS72Q15906 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
VPS72Q15906 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
VPS72Q15906 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
VPS72Q15906 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
VPS72Q15906 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
VPS72Q15906 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
VPS72Q15906 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
VPS72Q15906 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
VPS72Q15906 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
VPS72Q15906 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
VPS72Q15906 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
VPS72Q15906 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
VPS72Q15906 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
VPS72Q15906 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
VPS72Q15906 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
VPS72Q15906 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
VPS72Q15906 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
VPS72Q15906 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
VPS72Q15906 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
VPS72Q15906 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
VPS72Q15906 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
VPS72Q15906 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
VPS72Q15906 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
VPS72Q15906 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
VPS72Q15906 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
VPS72Q15906 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
VPS72Q15906 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
VPS72Q15906 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
VPS72Q15906 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
VPS72Q15906 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
VPS72Q15906 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
VPS72Q15906 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
VPS72Q15906 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
VPS72Q15906 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
VPS72Q15906 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
VPS72Q15906 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
VPS72Q15906 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
VPS72Q15906 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
VPS72Q15906 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
VPS72Q15906 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
VPS72Q15906 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
VPS72Q15906 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
VPS72Q15906 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
VPS72Q15906 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
VPS72Q15906 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
VPS72Q15906 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
VPS72Q15906 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
VPS72Q15906 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
VPS72Q15906 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
VPS72Q15906 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
VPS72Q15906 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
VPS72Q15906 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
VPS72Q15906 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
VPS72Q15906 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
VPS72Q15906 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
VPS72Q15906 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
VPS72Q15906 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
VPS72Q15906 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
VPS72Q15906 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
VPS72Q15906 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
VPS72Q15906 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
VPS72Q15906 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
VPS72Q15906 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
VPS72Q15906 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
VPS72Q15906 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
VPS72Q15906 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
VPS72Q15906 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
VPS72Q15906 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
VPS72Q15906 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
VPS72Q15906 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
VPS72Q15906 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
VPS72Q15906 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
VPS72Q15906 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
VPS72Q15906 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
VPS72Q15906 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
VPS72Q15906 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
VPS72Q15906 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
VPS72Q15906 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
VPS72Q15906 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
VPS72Q15906 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
VPS72Q15906 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
VPS72Q15906 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
VPS72Q15906 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
VPS72Q15906 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
VPS72Q15906 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
VPS72Q15906 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
VPS72Q15906 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
VPS72Q15906 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
VPS72Q15906 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
VPS72Q15906 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
VPS72Q15906 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
VPS72Q15906 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
VPS72Q15906 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
VPS72Q15906 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
VPS72Q15906 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
VPS72Q15906 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
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