Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SF1Q15637 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SF1Q15637 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SF1Q15637 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SF1Q15637 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SF1Q15637 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SF1Q15637 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SF1Q15637 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SF1Q15637 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SF1Q15637 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SF1Q15637 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SF1Q15637 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SF1Q15637 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SF1Q15637 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SF1Q15637 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SF1Q15637 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SF1Q15637 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SF1Q15637 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SF1Q15637 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SF1Q15637 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SF1Q15637 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SF1Q15637 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SF1Q15637 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SF1Q15637 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SF1Q15637 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SF1Q15637 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SF1Q15637 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SF1Q15637 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SF1Q15637 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SF1Q15637 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SF1Q15637 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SF1Q15637 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SF1Q15637 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SF1Q15637 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SF1Q15637 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SF1Q15637 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SF1Q15637 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SF1Q15637 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SF1Q15637 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SF1Q15637 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SF1Q15637 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SF1Q15637 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SF1Q15637 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SF1Q15637 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SF1Q15637 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SF1Q15637 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SF1Q15637 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SF1Q15637 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SF1Q15637 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SF1Q15637 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SF1Q15637 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SF1Q15637 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SF1Q15637 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SF1Q15637 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SF1Q15637 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SF1Q15637 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SF1Q15637 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SF1Q15637 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SF1Q15637 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SF1Q15637 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SF1Q15637 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SF1Q15637 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SF1Q15637 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SF1Q15637 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SF1Q15637 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SF1Q15637 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SF1Q15637 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SF1Q15637 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SF1Q15637 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SF1Q15637 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SF1Q15637 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SF1Q15637 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SF1Q15637 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SF1Q15637 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SF1Q15637 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SF1Q15637 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SF1Q15637 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SF1Q15637 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SF1Q15637 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SF1Q15637 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SF1Q15637 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SF1Q15637 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SF1Q15637 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SF1Q15637 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SF1Q15637 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SF1Q15637 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SF1Q15637 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SF1Q15637 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SF1Q15637 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SF1Q15637 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SF1Q15637 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SF1Q15637 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SF1Q15637 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SF1Q15637 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SF1Q15637 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SF1Q15637 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SF1Q15637 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SF1Q15637 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SF1Q15637 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SF1Q15637 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
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