Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCM1Q15154 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCM1Q15154 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCM1Q15154 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCM1Q15154 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCM1Q15154 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCM1Q15154 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCM1Q15154 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCM1Q15154 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCM1Q15154 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCM1Q15154 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PCM1Q15154 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCM1Q15154 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCM1Q15154 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCM1Q15154 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PCM1Q15154 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCM1Q15154 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCM1Q15154 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCM1Q15154 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCM1Q15154 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCM1Q15154 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCM1Q15154 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCM1Q15154 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCM1Q15154 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCM1Q15154 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCM1Q15154 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
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