Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PMS2P3Q13401 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PMS2P3Q13401 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
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