Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
STX4Q12846 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
STX4Q12846 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
STX4Q12846 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
STX4Q12846 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
STX4Q12846 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
STX4Q12846 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
STX4Q12846 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
STX4Q12846 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
STX4Q12846 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
STX4Q12846 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
STX4Q12846 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
STX4Q12846 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
STX4Q12846 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
STX4Q12846 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
STX4Q12846 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
STX4Q12846 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
STX4Q12846 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
STX4Q12846 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
STX4Q12846 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
STX4Q12846 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
STX4Q12846 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
STX4Q12846 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
STX4Q12846 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
STX4Q12846 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
STX4Q12846 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
STX4Q12846 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
STX4Q12846 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
STX4Q12846 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
STX4Q12846 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
STX4Q12846 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
STX4Q12846 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
STX4Q12846 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
STX4Q12846 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
STX4Q12846 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
STX4Q12846 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
STX4Q12846 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
STX4Q12846 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
STX4Q12846 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
STX4Q12846 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
STX4Q12846 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
STX4Q12846 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
STX4Q12846 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
STX4Q12846 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
STX4Q12846 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
STX4Q12846 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
STX4Q12846 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
STX4Q12846 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
STX4Q12846 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
STX4Q12846 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
STX4Q12846 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
STX4Q12846 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
STX4Q12846 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
STX4Q12846 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
STX4Q12846 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
STX4Q12846 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
STX4Q12846 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
STX4Q12846 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
STX4Q12846 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
STX4Q12846 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
STX4Q12846 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
STX4Q12846 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
STX4Q12846 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
STX4Q12846 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
STX4Q12846 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
STX4Q12846 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
STX4Q12846 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
STX4Q12846 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
STX4Q12846 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
STX4Q12846 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
STX4Q12846 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
STX4Q12846 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
STX4Q12846 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
STX4Q12846 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
STX4Q12846 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
STX4Q12846 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
STX4Q12846 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
STX4Q12846 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
STX4Q12846 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
STX4Q12846 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
STX4Q12846 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
STX4Q12846 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
STX4Q12846 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
STX4Q12846 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
STX4Q12846 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
STX4Q12846 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
STX4Q12846 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
STX4Q12846 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
STX4Q12846 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
STX4Q12846 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
STX4Q12846 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
STX4Q12846 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
STX4Q12846 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
STX4Q12846 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
STX4Q12846 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
STX4Q12846 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
STX4Q12846 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
STX4Q12846 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
STX4Q12846 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
STX4Q12846 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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