Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCAPQ12770 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAPQ12770 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAPQ12770 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAPQ12770 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAPQ12770 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAPQ12770 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAPQ12770 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAPQ12770 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAPQ12770 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAPQ12770 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAPQ12770 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAPQ12770 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAPQ12770 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAPQ12770 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAPQ12770 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAPQ12770 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAPQ12770 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAPQ12770 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAPQ12770 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCAPQ12770 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCAPQ12770 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCAPQ12770 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SCAPQ12770 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SCAPQ12770 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SCAPQ12770 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
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