Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC3A1Q07837 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms