Protein–RNA interactions for Protein: Q04118

PRB3, Basic salivary proline-rich protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB3Q04118 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PRB3Q04118 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms