Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DSC2Q02487 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DSC2Q02487 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DSC2Q02487 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DSC2Q02487 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DSC2Q02487 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DSC2Q02487 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DSC2Q02487 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DSC2Q02487 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DSC2Q02487 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DSC2Q02487 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DSC2Q02487 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DSC2Q02487 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DSC2Q02487 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DSC2Q02487 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DSC2Q02487 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DSC2Q02487 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DSC2Q02487 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DSC2Q02487 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DSC2Q02487 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DSC2Q02487 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DSC2Q02487 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DSC2Q02487 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DSC2Q02487 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DSC2Q02487 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DSC2Q02487 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DSC2Q02487 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DSC2Q02487 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DSC2Q02487 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DSC2Q02487 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DSC2Q02487 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSC2Q02487 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DSC2Q02487 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DSC2Q02487 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSC2Q02487 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSC2Q02487 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DSC2Q02487 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSC2Q02487 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSC2Q02487 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSC2Q02487 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DSC2Q02487 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DSC2Q02487 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSC2Q02487 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSC2Q02487 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSC2Q02487 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSC2Q02487 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSC2Q02487 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSC2Q02487 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DSC2Q02487 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSC2Q02487 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSC2Q02487 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSC2Q02487 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSC2Q02487 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSC2Q02487 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSC2Q02487 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSC2Q02487 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSC2Q02487 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSC2Q02487 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSC2Q02487 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSC2Q02487 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSC2Q02487 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSC2Q02487 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSC2Q02487 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSC2Q02487 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSC2Q02487 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSC2Q02487 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSC2Q02487 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSC2Q02487 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSC2Q02487 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSC2Q02487 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSC2Q02487 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSC2Q02487 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DSC2Q02487 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSC2Q02487 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSC2Q02487 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSC2Q02487 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSC2Q02487 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSC2Q02487 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSC2Q02487 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSC2Q02487 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSC2Q02487 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSC2Q02487 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSC2Q02487 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSC2Q02487 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DSC2Q02487 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSC2Q02487 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSC2Q02487 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSC2Q02487 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSC2Q02487 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSC2Q02487 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSC2Q02487 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSC2Q02487 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSC2Q02487 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSC2Q02487 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSC2Q02487 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSC2Q02487 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
DSC2Q02487 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DSC2Q02487 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DSC2Q02487 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DSC2Q02487 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms