Protein–RNA interactions for Protein: Q01638

IL1RL1, Interleukin-1 receptor-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RL1Q01638 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IL1RL1Q01638 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IL1RL1Q01638 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IL1RL1Q01638 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IL1RL1Q01638 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IL1RL1Q01638 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IL1RL1Q01638 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
IL1RL1Q01638 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IL1RL1Q01638 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IL1RL1Q01638 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IL1RL1Q01638 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IL1RL1Q01638 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
IL1RL1Q01638 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IL1RL1Q01638 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IL1RL1Q01638 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IL1RL1Q01638 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IL1RL1Q01638 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IL1RL1Q01638 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
IL1RL1Q01638 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IL1RL1Q01638 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IL1RL1Q01638 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IL1RL1Q01638 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IL1RL1Q01638 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IL1RL1Q01638 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IL1RL1Q01638 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
IL1RL1Q01638 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IL1RL1Q01638 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IL1RL1Q01638 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IL1RL1Q01638 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IL1RL1Q01638 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IL1RL1Q01638 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IL1RL1Q01638 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IL1RL1Q01638 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IL1RL1Q01638 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IL1RL1Q01638 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IL1RL1Q01638 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IL1RL1Q01638 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IL1RL1Q01638 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IL1RL1Q01638 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IL1RL1Q01638 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IL1RL1Q01638 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IL1RL1Q01638 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IL1RL1Q01638 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IL1RL1Q01638 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IL1RL1Q01638 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IL1RL1Q01638 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IL1RL1Q01638 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IL1RL1Q01638 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IL1RL1Q01638 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IL1RL1Q01638 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IL1RL1Q01638 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
IL1RL1Q01638 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IL1RL1Q01638 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IL1RL1Q01638 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IL1RL1Q01638 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21■□□□□ 0.95
IL1RL1Q01638 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21■□□□□ 0.95
IL1RL1Q01638 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IL1RL1Q01638 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
IL1RL1Q01638 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IL1RL1Q01638 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IL1RL1Q01638 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
IL1RL1Q01638 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
IL1RL1Q01638 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
IL1RL1Q01638 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IL1RL1Q01638 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IL1RL1Q01638 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
IL1RL1Q01638 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IL1RL1Q01638 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IL1RL1Q01638 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IL1RL1Q01638 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IL1RL1Q01638 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IL1RL1Q01638 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IL1RL1Q01638 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IL1RL1Q01638 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IL1RL1Q01638 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IL1RL1Q01638 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IL1RL1Q01638 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IL1RL1Q01638 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IL1RL1Q01638 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IL1RL1Q01638 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IL1RL1Q01638 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IL1RL1Q01638 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IL1RL1Q01638 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IL1RL1Q01638 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IL1RL1Q01638 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IL1RL1Q01638 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IL1RL1Q01638 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IL1RL1Q01638 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IL1RL1Q01638 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IL1RL1Q01638 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IL1RL1Q01638 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IL1RL1Q01638 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IL1RL1Q01638 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IL1RL1Q01638 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IL1RL1Q01638 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
IL1RL1Q01638 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IL1RL1Q01638 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IL1RL1Q01638 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IL1RL1Q01638 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IL1RL1Q01638 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms