Protein–RNA interactions for Protein: Q00013

MPP1, 55 kDa erythrocyte membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MPP1Q00013 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MPP1Q00013 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MPP1Q00013 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MPP1Q00013 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MPP1Q00013 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MPP1Q00013 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MPP1Q00013 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MPP1Q00013 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MPP1Q00013 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MPP1Q00013 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MPP1Q00013 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MPP1Q00013 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MPP1Q00013 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MPP1Q00013 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MPP1Q00013 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MPP1Q00013 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MPP1Q00013 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MPP1Q00013 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MPP1Q00013 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MPP1Q00013 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MPP1Q00013 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MPP1Q00013 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MPP1Q00013 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MPP1Q00013 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MPP1Q00013 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MPP1Q00013 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MPP1Q00013 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MPP1Q00013 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MPP1Q00013 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MPP1Q00013 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MPP1Q00013 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MPP1Q00013 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MPP1Q00013 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MPP1Q00013 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MPP1Q00013 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MPP1Q00013 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MPP1Q00013 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MPP1Q00013 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MPP1Q00013 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MPP1Q00013 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MPP1Q00013 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MPP1Q00013 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MPP1Q00013 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MPP1Q00013 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MPP1Q00013 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MPP1Q00013 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MPP1Q00013 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MPP1Q00013 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MPP1Q00013 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MPP1Q00013 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MPP1Q00013 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MPP1Q00013 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MPP1Q00013 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MPP1Q00013 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MPP1Q00013 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MPP1Q00013 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MPP1Q00013 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MPP1Q00013 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MPP1Q00013 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MPP1Q00013 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MPP1Q00013 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MPP1Q00013 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MPP1Q00013 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MPP1Q00013 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MPP1Q00013 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MPP1Q00013 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MPP1Q00013 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MPP1Q00013 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MPP1Q00013 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MPP1Q00013 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MPP1Q00013 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MPP1Q00013 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MPP1Q00013 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MPP1Q00013 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MPP1Q00013 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MPP1Q00013 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MPP1Q00013 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MPP1Q00013 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MPP1Q00013 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MPP1Q00013 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MPP1Q00013 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MPP1Q00013 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MPP1Q00013 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MPP1Q00013 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MPP1Q00013 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MPP1Q00013 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MPP1Q00013 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MPP1Q00013 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MPP1Q00013 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MPP1Q00013 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MPP1Q00013 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MPP1Q00013 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MPP1Q00013 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MPP1Q00013 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MPP1Q00013 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MPP1Q00013 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MPP1Q00013 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MPP1Q00013 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MPP1Q00013 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MPP1Q00013 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms