Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SSBP2P81877 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSBP2P81877 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms