Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL23P62829 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL23P62829 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL23P62829 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL23P62829 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL23P62829 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL23P62829 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL23P62829 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL23P62829 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL23P62829 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL23P62829 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL23P62829 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL23P62829 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL23P62829 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL23P62829 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL23P62829 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL23P62829 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL23P62829 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL23P62829 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL23P62829 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL23P62829 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL23P62829 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL23P62829 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL23P62829 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL23P62829 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL23P62829 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL23P62829 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL23P62829 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL23P62829 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL23P62829 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL23P62829 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL23P62829 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RPL23P62829 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RPL23P62829 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
RPL23P62829 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RPL23P62829 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL23P62829 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL23P62829 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL23P62829 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL23P62829 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL23P62829 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL23P62829 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL23P62829 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL23P62829 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL23P62829 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL23P62829 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL23P62829 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL23P62829 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL23P62829 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL23P62829 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL23P62829 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL23P62829 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL23P62829 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL23P62829 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL23P62829 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL23P62829 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL23P62829 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL23P62829 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL23P62829 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL23P62829 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL23P62829 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL23P62829 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL23P62829 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL23P62829 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL23P62829 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL23P62829 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL23P62829 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL23P62829 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL23P62829 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL23P62829 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL23P62829 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL23P62829 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL23P62829 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL23P62829 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL23P62829 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL23P62829 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL23P62829 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL23P62829 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL23P62829 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL23P62829 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL23P62829 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL23P62829 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL23P62829 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL23P62829 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL23P62829 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL23P62829 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL23P62829 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL23P62829 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL23P62829 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL23P62829 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL23P62829 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL23P62829 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL23P62829 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL23P62829 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL23P62829 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL23P62829 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL23P62829 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL23P62829 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL23P62829 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL23P62829 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms