Protein–RNA interactions for Protein: P60174

TPI1, Triosephosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPI1P60174 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPI1P60174 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPI1P60174 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPI1P60174 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPI1P60174 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPI1P60174 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPI1P60174 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPI1P60174 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPI1P60174 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPI1P60174 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPI1P60174 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPI1P60174 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TPI1P60174 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPI1P60174 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPI1P60174 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPI1P60174 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPI1P60174 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPI1P60174 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPI1P60174 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPI1P60174 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPI1P60174 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TPI1P60174 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPI1P60174 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPI1P60174 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TPI1P60174 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPI1P60174 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPI1P60174 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPI1P60174 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPI1P60174 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPI1P60174 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPI1P60174 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPI1P60174 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPI1P60174 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPI1P60174 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TPI1P60174 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPI1P60174 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPI1P60174 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPI1P60174 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPI1P60174 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPI1P60174 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPI1P60174 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPI1P60174 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPI1P60174 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPI1P60174 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPI1P60174 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPI1P60174 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPI1P60174 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPI1P60174 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPI1P60174 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPI1P60174 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPI1P60174 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPI1P60174 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPI1P60174 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPI1P60174 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPI1P60174 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPI1P60174 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPI1P60174 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPI1P60174 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TPI1P60174 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPI1P60174 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPI1P60174 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPI1P60174 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPI1P60174 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPI1P60174 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPI1P60174 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPI1P60174 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPI1P60174 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPI1P60174 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPI1P60174 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPI1P60174 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPI1P60174 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPI1P60174 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TPI1P60174 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPI1P60174 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPI1P60174 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPI1P60174 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPI1P60174 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPI1P60174 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPI1P60174 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPI1P60174 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPI1P60174 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPI1P60174 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPI1P60174 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPI1P60174 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPI1P60174 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TPI1P60174 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPI1P60174 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TPI1P60174 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPI1P60174 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPI1P60174 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPI1P60174 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPI1P60174 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TPI1P60174 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPI1P60174 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPI1P60174 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPI1P60174 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPI1P60174 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TPI1P60174 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TPI1P60174 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPI1P60174 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms