Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMTNP53814 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMTNP53814 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMTNP53814 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMTNP53814 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMTNP53814 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMTNP53814 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMTNP53814 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SMTNP53814 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SMTNP53814 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SMTNP53814 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMTNP53814 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMTNP53814 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMTNP53814 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMTNP53814 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMTNP53814 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMTNP53814 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMTNP53814 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMTNP53814 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SMTNP53814 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMTNP53814 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMTNP53814 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SMTNP53814 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMTNP53814 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMTNP53814 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMTNP53814 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMTNP53814 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMTNP53814 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMTNP53814 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SMTNP53814 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMTNP53814 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMTNP53814 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMTNP53814 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMTNP53814 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMTNP53814 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMTNP53814 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMTNP53814 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMTNP53814 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMTNP53814 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMTNP53814 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMTNP53814 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMTNP53814 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMTNP53814 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMTNP53814 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMTNP53814 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMTNP53814 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMTNP53814 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMTNP53814 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMTNP53814 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SMTNP53814 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMTNP53814 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMTNP53814 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMTNP53814 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMTNP53814 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMTNP53814 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMTNP53814 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMTNP53814 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMTNP53814 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMTNP53814 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMTNP53814 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMTNP53814 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMTNP53814 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMTNP53814 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SMTNP53814 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMTNP53814 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SMTNP53814 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMTNP53814 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMTNP53814 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SMTNP53814 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMTNP53814 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMTNP53814 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMTNP53814 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMTNP53814 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SMTNP53814 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMTNP53814 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMTNP53814 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMTNP53814 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMTNP53814 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMTNP53814 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMTNP53814 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMTNP53814 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMTNP53814 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMTNP53814 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMTNP53814 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMTNP53814 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMTNP53814 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SMTNP53814 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMTNP53814 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMTNP53814 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMTNP53814 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMTNP53814 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMTNP53814 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMTNP53814 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMTNP53814 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMTNP53814 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMTNP53814 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMTNP53814 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMTNP53814 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMTNP53814 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMTNP53814 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms