Protein–RNA interactions for Protein: P42785

PRCP, Lysosomal Pro-X carboxypeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCPP42785 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRCPP42785 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRCPP42785 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRCPP42785 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRCPP42785 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PRCPP42785 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRCPP42785 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRCPP42785 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRCPP42785 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRCPP42785 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRCPP42785 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRCPP42785 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRCPP42785 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRCPP42785 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRCPP42785 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRCPP42785 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRCPP42785 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PRCPP42785 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRCPP42785 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRCPP42785 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRCPP42785 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRCPP42785 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRCPP42785 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRCPP42785 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRCPP42785 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRCPP42785 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRCPP42785 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRCPP42785 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRCPP42785 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRCPP42785 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRCPP42785 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRCPP42785 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRCPP42785 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRCPP42785 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRCPP42785 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRCPP42785 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PRCPP42785 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PRCPP42785 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRCPP42785 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRCPP42785 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRCPP42785 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRCPP42785 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRCPP42785 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRCPP42785 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRCPP42785 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PRCPP42785 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRCPP42785 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRCPP42785 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRCPP42785 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRCPP42785 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRCPP42785 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRCPP42785 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRCPP42785 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRCPP42785 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRCPP42785 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PRCPP42785 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRCPP42785 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRCPP42785 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRCPP42785 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRCPP42785 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRCPP42785 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRCPP42785 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRCPP42785 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRCPP42785 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRCPP42785 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRCPP42785 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRCPP42785 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRCPP42785 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRCPP42785 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRCPP42785 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PRCPP42785 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRCPP42785 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRCPP42785 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRCPP42785 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRCPP42785 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRCPP42785 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRCPP42785 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRCPP42785 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRCPP42785 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRCPP42785 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRCPP42785 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRCPP42785 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRCPP42785 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRCPP42785 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRCPP42785 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRCPP42785 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRCPP42785 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRCPP42785 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRCPP42785 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRCPP42785 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRCPP42785 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PRCPP42785 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRCPP42785 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRCPP42785 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRCPP42785 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRCPP42785 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRCPP42785 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRCPP42785 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRCPP42785 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRCPP42785 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms